汉坦病毒z10株m片段全基因序列分析.docVIP

???? 汉坦病毒Z10株M片段全基因序列分析 ???? ????【 摘要 】　目的　测定我国疫苗株Z10的M片段全基因序列，了解其分子基础，并分析其与其它汉坦病毒株的遗传学差异。 方法　从Z10株病毒感染的细胞提取总RNA，将逆转录PCR扩增的产物纯化后克隆于T载体并进行序列测定，应用DNASTAR软件分析比较。 结果　 Z10株M片段的全基因序列共3 615个核苷酸，四种核苷酸的比例分别为A 30.15%，T 29.41%，G 21.72%，C 18.73%。以第二种读码方式推导出其最大读码框架从41到3 448，共编码1 135个氨基酸。序列同源分析表明，Z10株与HTN型核苷酸同源性为83.6%～87.4%，与SEO，DOB和Thai型为69.5%～70.8%，而与PUU和HPS各型病毒同源性仅为57.6%～59.9%。氨基酸同源分析Z10株与HTN型同源性高达94.2%～96.0%，与SEO，DOB和Thai型为73.3%～76.6%，而与PUU和HPS各型病毒同源仅为53.2%～56.3%。绘出了核苷酸和氨基酸的系统发生树。 结论　Z10株为不同于已报告M片段全基因序列的HTN型国内外毒株的另一亚型，并具有16个独特的氨基酸。　　【 主题词 】　汉坦病毒；Z10株；M片段；序列分析 Complete sequence analysis of the M geno