Affymetrix基因芯片原始数据噪声分析与应用.docVIP

中国科技论文在线 PAGE PAGE 4 Affymetrix基因芯片原始数据噪声分析与应用 金圣华基金项目：国家自然科学基金项目、教育部高校博士点基金项目（20070287051）、教育部留学回国科研启动基金项目和南京航空航天大学基本科研业务费专项科研项目(NS2010104)的支持作者简介 基金项目：国家自然科学基金项目、教育部高校博士点基金项目（20070287051）、教育部留学回国科研启动基金项目和南京航空航天大学基本科研业务费专项科研项目(NS2010104)的支持 作者简介 ：金圣华(1979-) ，女，硕士，讲师，主要研究领域为生物信息学。 通信联系人: 刘学军，博士，副教授，主要研究领域为机器学习和生物信息学。 E-mail： xuejun.liu@。 (1 南京航空航天大学 信息科学与技术学院 ，江苏 南京210016; 2 淮阴工学院 计算机工程学院 ，江苏 淮安 223001) 摘要：基于杂交原理的生物芯片技术由于实验中非特异性杂交的存在，导致实验数据包含较高的噪音。针对目前广泛使用的Affymetrix GeneChip基因芯片，通过对原始数据进行分析研究，得到探针中间三个核苷酸序列和MM/PM探针灰度比值的对应关系,将该对应关系嵌入