一代测序结果峰图的基本知识.docVIP

下载本文档

1791
0
约小于1千字
约 6页
2020-07-19 发布于广东
举报
版权申诉

一代测序结果峰图的基本知识.doc

1、原创力文档（book118）网站文档一经付费（服务费），不意味着购买了该文档的版权，仅供个人/单位学习、研究之用，不得用于商业用途，未经授权，严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等，侵权必究。。
2、本站所有内容均由合作方或网友上传，本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺！文档内容仅供研究参考，付费前请自行鉴别。如您付费，意味着您自己接受本站规则且自行承担风险，本站不退款、不进行额外附加服务；查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档，您可以点击这里二次下载。
3、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等，请点击“版权申诉”（推荐），也可以打举报电话：400-050-0827(电话支持时间：9:00-18:30)。
4、该文档为VIP文档，如果想要下载，成为VIP会员后，下载免费。
5、成为VIP后，下载本文档将扣除1次下载权益。下载后，不支持退款、换文档。如有疑问请联系我们。
6、成为VIP后，您将拥有八大权益，权益包括：VIP文档下载权益、阅读免打扰、文档格式转换、高级专利检索、专属身份标志、高级客服、多端互通、版权登记。
7、VIP文档为合作方或网友上传，每下载1次，网站将根据用户上传文档的质量评分、类型等，对文档贡献者给予高额补贴、流量扶持。如果你也想贡献VIP文档。上传文档

一代测序结果峰图的基本知识 1、一代测序结果测序公司发送的测序结果一般有一个峰图文件和一个序列文件，峰图文件为ABI格式，用chromas软件（网上可下载）打开。峰图用四种颜色的波形代表四种碱基的信号强度；正常的峰图，波峰与波谷清晰，峰与峰之间的距离均匀；比较理想的测序结果在底部应该没有杂峰干扰； 2、起始序列说明 1）测序结果的前几十bp不能用（下图中黄色区域标出的区域），在拼接序列或序列比对时需要先去除这部分不太可靠的数据，以免影响分析结果； 2）在使用PCR引物测序时由于PCR引物上的碱基是不带染料的，所以检测不到信号，在测序结果中也找不到引物的序列，如连接到载体使用载体上的通用引物测序则可以找到PCR引物； 3、有效读长测序公司给出的峰图在1000～1200bp之间，但超过800bp后的各种波之间有重叠，波峰有钝化现象，碱基与碱基间的距离有时突然加大（此图中的812bp~813bp），这些现象都会影响结果的准确性，所以只能做为参考．所以说有效片段为800bp左右． 4、SNP位点 SNP位点为纯合时成单峰，若主杂合子时，会形成套峰现象；测序公司给的结果序列文件通常只读主峰——即序列文件不会报告SNP杂合，需要自己打开峰图文件判读。