分子标记辅助育种 课件.pptVIP

Mardler ×百农 3217 的近等基因系 F2 BC1 DH RIL 群体 形成 F1 自交后 代 F1 回交后 代 F1 花粉分 化个体 F2 个体自 交后代 性状研究 对象 个体 个体 品系 品系 准确度 低 低 高 高 必要的群 体规模 大 大 中 中 分离比例 1:2:3 或 3:1 1:1 1:1 1:1 不同作图群体的特点 确定育种性状 确定有极端差异的亲本 构建遗传分离群体 表型分析遗传分离群体 分子标记鉴定基因型 构建分子连锁图谱 获得与目标性状紧密连锁的分子标记 70 － 200 个标记鉴定 亲本多态性 70 － 300 lines F2 、 BC 或 RIL MapMaker JoinMap Variance analysis MapMaker/QTL BSA 法 分子标记 质量性状 数量性状 二、 分子标记与基因定位 5`-3` 序列 Sequence 扩 增 条 带 数 Amplified fragments 多 态 性 标 记 数 Polymorphic fragments 5`-3` 序列 Sequence 扩 增 条 带 数 Amplified fragments 多 态 性 标 记 数 Polymorphic fragments GGG(ACA) 5 7 7 TTC(CCA) 5 8 6 GA T(ACA) 5 12 4 GAG(CGA) 5 9 8 GAC(ACA) 5 9 5 GTT(CGA) 5 8 7 GGG(CCA) 5 6 4 GCC(CGA) 5 8 7 GA T(CCA) 5 8 8 AAG(CGA) 5 13 9 GAC(CCA) 5 10 5 ATT(CGA) 5 8 4 AGG(CCA) 5 8 5 ATC(CGA) 5 11 3 AA T(CCA) 5 8 7 TAG(CGA) 5 10 9 AAC(CCA) 5 12 10 TTT(CGA) 5 9 6 TGG(CCA) 5 9 7 TCC(CGA) 5 9 7 TA T(CCA) 5 6 6 4 .6 SSCP ( 单链构象的多态性 ) ( S ingle S trand C onformation P olymorphism) A T G C 变性 复性 SSCP ( 单链构象的多型性 ) (Single Strand Conformation Polymorphism) 家 猪 氟 烷 基 因 SSCP 图 谱 MNAAAAAAAAAAA mRNA MNAAAAAAAAAAA NMTTTTTTTTTTTTT 扩增 电泳 回收，克隆 测序，探针 MNAAAAAAAAAAA NMTTTTTTTTTTTTT cDNA 4.7 DD-PCR (Differential display-PCR) 3 端锚定引物 : 11 个或 12 个连续 的 T 加上两个 3 - 端锚定的脱氧核 苷酸组成 10-mer 的随机引 物 DD-PCR ( 基于 PCR 的差异显示 ) 技术： cDNA 合成 random primer PCR anchor primer PCR 依赖： 等位基因在转录水平上的差异表达； 等位基因的结构变异 ； DD-PCR ? 技术： Rare cutter RE (6 Nt site ， Eco RI) Frequency cutter RE (4 Nt site ， TaqI ， Mse I) adapter sequence primer(adapter + Cutting site) PCR PAGE ? 依赖： RE 切点的突变 切点 3 序列的突变 4.8 AFLP 标记 1993 年 Zabeau 和 Vos 发明 是 RFLP 和 PC