清华分子动学模拟入门详解.ppt

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多体系统一分子动力学 Multi-body System Molecular Dynamics 弓 物质基本构成一分子、原子 在分子、原子这个微观水平上来考察物质:多体 世界 查清楚微观世界,宏观就清楚了 从微观考虑问题的现实可行性 从微观考虑问题的必要性 物性的观测性参数:热传导、温度、压力、粘 性 微观处理的前提 已知微观粒子间的相互作用 假设 分子为球,惰性,分子间的作用只取决于分子间 的距离 分子动力学( Molecular Dynamics,MD) MD的应用 领域:物理、化学、生物、材料等 MD方法能实时将分子的动态行为显示到计算机屏 幕上,便于直观了解体系在一定条件下的演变过程 MD含温度与时间,因此还可得到如材料的玻璃化转 变温度、热容、晶体结晶过程、输送过程、膨胀过 程、动态弛豫(〔 relax)以及体系在外场作用下的变化 过程等 水和离子在微小硅孔中的运动 聚乙烯的结晶 MD的基本原理 用牛顿经典力学计算许多分子在相空间中的 轨迹 求解系统中的分子或原子间作用势能和系统外加 约束共同作用的分子或原子的牛顿方程。 模拟系统随时间推进的微观过程。 通过统计方法得到系统的平衡参数或输运性质 计算程序较为复杂,占用较多内存

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