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一个问题 为什么NCCN指南对20外显子插入突变提示
“可能预测临床对TKIs耐药”?
EGFR20 外显子插入突变通常认为对TKI耐药,NCCN指南并没有给出一个完全耐药的提示。
下面两个研究会使我们对这一位点有更准确的理解。一项来自2013年发表在《Sci Transl Med》对肺癌中20外显子 插入突变的结构、生化和临床特征的研究。先来看下20外显子插入在EGFR结构上的位置,20外显子在激酶结构域上构成C-螺旋和环,即图1黄色螺旋和后面紫色环状。再直观看下20外显子不同插入位点所处结构位置,见图1右图所示。
这些不同类型的20外显子插入位点对TKI药物反应如何呢?研究者分析了19例不同20外显子插入类型经吉非替尼或厄罗替尼治疗的患者。其中3例携带EGFR A763_Y764insFQEA的患者2例部分缓解,1例稳定,见图2。尽管患者总数少, A763_Y764insFQEA的RR达到了66.6% (2/3),对比其他C-螺旋上或以外的位点RR为0%(0/16;p=0.0175),同样A763_Y764insFQEA患者的PFS比其他类型20外显子插入的也更长(5.5月vs 1.0月),见图3。
图2.不同20外显子插入位点患者对TKI的疗效:黄色表示部分缓减(PR),蓝色表示疾病稳定(SD),红色表示疾病进展(PD),*表示患者PD但病灶无法测量。右表是每一个患者对TKI的响应情况。
图3. Kaplan-Meier PFS曲线分析。 数据分析来自A763_Y764insFQEA 突变的3例 NSCLC对比16例其他20外显子的插入。
研究者在患者临床试验前也在体外测试了含不同20外显子插入突变的细胞系对TKI的敏感性,选取了C-螺旋内2种A763_Y764insFQEA和Y764_V765insHH,C-螺旋末端环内的M766_A767insAI, A767_V769dupASV [等同于 V769_D770insASV], D770_N771insNPG, D770_N771insSVD [等同于S768_D770dupSVD] 和 H773_V774insH [等同于P772_H773insH])。细胞成活实验结果显示非典型的A763_Y764insFQEA 和EGFR-delL747_P753insS和 L858R一样 厄罗替尼抑制浓度低于0.1μM (图4),而其他的EGFR 20外显子插入类型和L858R-T790M IC50s均超过2 μM 厄罗替尼。
图4.表达EGFR-delL747_P753insS, delL747_P753insS+T790M,A763_Y764insFQEA, Y764_V765insHH, M766_A767insAI, A767_V769dupASV,D770_N771insNPG, D770_N771insSVD, H773_V774insH, L858R and L858R+T790M的 Ba/F3细胞生长抑制剂量依赖实验。表达不同突变类型EGFR的Ba/F3厄罗替尼处理72小时,分析细胞成活。每个样品重复3次,IC50是3次实验的平均值。
研究者又从蛋白晶体结构层面对耐药的20外显子插入和不典型的A763_Y764insFQEA做了分析,TKI-不敏感的突变以D770_N771insNPG为代表,晶体结构提示这种类型因为插入的残基在C-螺旋末端形成一个“楔子”导致结合ATP的“口袋”不能变化,意味着这种突变活化EGFR但不能增加对EGFR-TKI的亲和性,也就对TKI不敏感。不典型的A763_Y764insFQEA未能得到晶体结构,通过模型分析提示插入片段使C-螺旋往N端迁移,C-螺旋上重要的E762也恰好被FQEA中的E替代(图5)。在这个基础上,C-螺旋的迁移使I759被丙氨酸所替代,I759,L747,L858和L861都是稳定蛋白非活性构型的疏水基团(图6)。L858R 和 L861Q 是敏感突变,L747突变也是。据此推测FQEA插入引起的I759A与L858R 和 L861Q活化EGFR的机制类似,也同样对TKI敏感,只是敏感程度有差异。
图5.C-螺旋区域野生型和 FQEA插入序列的比对。
插入的FQEA 残基 (黑体)可能迁移C-螺旋往C端方向(上面)也可能往N端方向(下面) ,N端方向可以保持关键活性位点762仍然是谷氨酸,N端迁移将拉长C-螺旋前面的环 (β3-αC)。
图6.EGFR非活性构型时FQEA插入的同源模型。疏水基团簇(黄色侧链)对于非活性构型的稳定
是非常重要的,L858R和L861Q都是该簇的一部分。FQEA插入将导致I759A,还会改变
β3-αC的长度和构象,这区域正是19外显子缺失的位置。
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