GEO数据库简介PPT课件.pptVIP

GEO数据的数据检索——方法 直接从NCBI主页用Entrez进行检索。 GEO数据主要存放在GEO DataSets和GEO Profiles两个数据库内。 Entrez是NCBI建立的生物医学数据库集成检索系统。Entrez集成系统的最大特点是通过任何一个数据库检索出的信息可直接链接到Entrez其它数据库并找到相关的检索结果。 * GEO数据的数据检索——关键词 GEO可和其他NCBI数据库一样用标准关键词的方法和基于文本布尔检索、基于序列检索、基于特有表达行为挖掘检索或结合这些参数来进行检索查询 例如：在GEO DataSets中可以用检索词“prostate cancer AND human[Organism] ”寻找有关人类前列腺癌微阵列实验数据集。 * GEO数据的数据检索——关键词 例如：在GEO Profiles数据库中可以用检索词fto[Gene Symbol] AND （Smok*）搜索所有与吸烟相关并包含肥胖基因的相关实验的基因表达谱。 * GEO数据的处理 非加权组平均法聚类小图 实验数据下载 数据分析工具 * Find genes： Find gene name or symbol：直接查找数据