LAMMPS手册-中文版讲解 .pdfVIP

LAMMPS 手册- 中文解析 一、 简介 本部分大至介绍了 LAMMPS 的一些功能和缺陷。 1． 什么是LAMMPS? LAMMPS 是一个经典的分子动力学代码，他可以模拟液体中的粒子，固体和汽体的 系综。他可以采用不同的力场和边界条件来模拟全原子，聚合物，生物，金属，粒状和 粗料化体系。LAMMPS 可以计算的体系小至几个粒子，大到上百万甚至是上亿个粒子。 LAMMPS 可以在单个处理器的台式机和笔记本本上运行且有较高的计算效率，但是 它是专门为并行计算机设计的。他可以在任何一个按装了 C++编译器和 MPI 的平台上运 算，这其中当然包括分布式和共享式并行机和 Beowulf 型的集群机。 LAMMPS 是一可以修改和扩展的计算程序，比如，可以加上一些新的力场，原子模 型，边界条件和诊断功能等。 通常意义上来讲，LAMMPS 是根据不同的边界条件和初始条件对通过短程和长程力 相互作用的分子，原子和宏观粒子集合对它们的牛顿运动方程进行积分。高效率计算的 LAMMPS 通过采用相邻清单来跟踪他们邻近的粒子。这些清单是根据粒子间的短程互拆 力的大小进行优化过的，目的是防止局部粒子密度过高。在并