Chembiodraw结构式与命名.docxVIP

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化学软件应用 Chembiodraw Ultra 12.0 结构式与命名相互转换 Chemdraw Ultra 12.0 提供了多个绘图工具以方便用户绘制化学图形, 其中绘制化学结构的核心工具包括 9 个键工具, 10 个环工具和一个脂肪链工具。除此之外,还有各种大大小小的功能,本内容主要介绍菜单栏中 Structure 里几个命令的功能:如结构式与命名如何进行转换,结构式的检查及标准化。 结构式与命名相互转换 Chemdraw 既可根据化学结构命名。也可根据化学名称画出化学结构。 由结构式给出 IUPAC 标准命名 一般情况下, Chemdraw 采用 IUPAC 系统命名法命名化学结构, 它能自动识别杂环结构,同时也支持 Cahn-Ingold-Prelog 规则。将结构式命名,可以采取 3 种方法来实现。 第 1 种方法,以 N-苯乙基乙酰胺为例,选取整个结构式,单击菜单栏中的“ Structure”→ “Convert Structure to Name”命令,此时在结构式的正下方显示出 N-苯乙基乙酰胺的 IUPAC 名称为“ N-phenethylacetamide”;如图所示: 利用“套索”或“蓬罩”工具将整个结构式选中,然后单击菜单栏中的 此时在结构式的正下方显示出 IUPAC 名称 N-phenethylacetamide。“ Structure→ ”“ Conver 此时在结构式的正下方显示出 IUPAC 名称 N-phenethylacetamide。 第 2 种方法,在选中的结构式上右击,然后在弹出的快捷菜单中选择“ Analysis→”“ Name”命令,则可得到该结构的 IUPAC 名称; 第 3 种方法,利用快捷键快速命名,先选取整个结构式,然后使用组合键 <Ctrl+Alt+N> ,可直接在结构式的正下方显示出该结构的 IUPAC 名称。 由 IUPAC 标准命名给出结构式 Chemdraw 可将一个化合物的英文名称直接转化为化学结构式。除了能够将采用官方命名规则( IUPAC 命名规则, IUBMB 命名规则及 CAS 命名规则)命名的英文名称转换为化学结构外,还能直接将常用的俗称直接转换成化学结构。 以“ N-苯乙基乙酰胺”的化学结构为例,单击菜单栏中的 “Structure ”→“ Convert Name to Structure 命令”,弹出“ Insert Structure”对话框,在对话框的空白处输入 名称“ N-phenethylacetamide”,单击“ OK”按钮,即可获得“ N-苯乙基乙酰胺”的结构。如图所示: 单击菜单栏中的 “Structure ”→“ Convert Name to Stru命ct令ure, ” 弹 出 “ Insert Structure ” 对 话 框 , 在 对 话 框 的 空 白 处 输 入 名 称“ N-phenethylacetamide”, 单击“ OK”按钮,即可获得“ N-苯乙基乙酰胺”的结构。 另一种方法,即使用组合快捷键,使用 <Shift+Ctrl+N> , 出 现 insert structure 的对话框,其它步骤如上。 同时, Chemdraw 还能对一些常见的输入错误自动矫错。例如,在输入 N- 苯乙基乙酰胺的名称时 “N-phenethylacetamide 时”,因为大意写错了一个字母, 写成了“N- phenethylacetamode,”Chemdraw 将自动弹出一个对话框,提示正确的名 称是“N-phenethylacetamide ,”单击“确定”按钮,系统自动纠正书写错误,并给 出正确结构。 如果提示是否自动纠正时单击 “取消”按钮,系统将认为结构错误, 不会给出结构式。 当输入错误的名称:“N-phenethylacetamode”时 单击“ OK”会出现一个对话框,提示书写错误,并提示正确的输入名称,点击确定会得出正确的结构式, 如 果 点 击 取 消 , 则 系 统 认 为 结 构 错 误 , 不 会 给 出 结 构 式 。 结构检查 利用 Chemdraw绘制完结构式后,可以利用 “Structure ”→ “Check stru 命cture ” 令检查一下结构式是否正确。 结构式无误,则出现如下对话框: 图形的旋转与调整 仍然以上面的 N-苯乙基乙酰胺为例,首先复制所示化合物,在该化合物被 选择的情况下,选择透视工具 ,然后将光标置于被选择的结构式上,选择“ Structure ”→“ Clean up str命uc令tu,re使结构”式标准化。

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