icimapping 连锁图中文操作说明.pdfVIP

请注意: 开始之前, 请确认您的计算机已安装了QTL IciMapping集成软件! 遗传连锁图谱构建(MAP) 1. 打开软件: QTL IciMapping 软件可通 过两种方式打开 • 双击QTL IciMapping 软件在桌 面上的快捷图标 • 从”所有程序”菜单中选择QTL IciMapping 软件 2. 软件浏览. 单击StartPage 中的”左箭头”或”右箭头”, 可以看到: • 软件所能处理的遗传群体类型 • 共显性标记是如何编码的 • 显性标记是如何编码的 • 隐性标记是如何编码的 遗传连锁图谱构建 3. 建立一个”新工程” • 单击”File”菜单 • 选择”New Project” • 输入”工程名称” (例如, 图 示中的工程名称为Tutorial) 和选择路径(例如, 图示中 的路径为D:\) • 单击”OK” 完成”新工程”创 建 新建工程显示在”工程窗 口” 中 所有与此工程相关的各种 输入/输出, 按特定的组织 形式自动保存在路 径”D:\Tutorial\...”下的各 种文件夹中 遗传连锁图谱构建 4. 向新建工程中导入遗传群体 • 单击”File”菜单, 然后选择 File -> Open File -> *.map • 或者单击”Open”, 然后选择 *.map (Linkage map construction) 文件类型 • 在文件列表中选择要打开的 群体(例如: “C:\CAAS\QTL IciMapping\Examples\MAP\ ArabidopsisRIL.map”) • 单击”打开(O)” 完成 由此选择打开EXCEL 2003/2007文件 遗传连锁图谱构建 5. MAP功能浏览: MAP功能把窗口分为4部分 • 工程窗口 • 标记整理信息和结果展示窗口 • 锚定信息/分组信息/染色体信息展示窗口 • 参数选择/设置窗口 工程窗口 标记整理信息和 锚定信息/ 结果展示窗口 分组信息/ 染色体信息 展示窗口 参数选择/设置窗口 遗传连锁图谱构建 6. 标记分群 • 单击Grouping下的 箭头, 软件将利用默 认/设定参数对标记 进行分群, 例如图例 中, 按LOD临界值 3.00 的标准分群 7. 标记排序 • 单击Ordering下的箭 头, 软件将利用默认 /设定参数对标记进 行排序, 例如图例中, 利用nnTwoOpt算法