pir蛋白质序列数据库.pptVIP

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  • 2021-03-21 发布于广东
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PIR 蛋白质序列数据库;PIR的产生 ;PIR的概念 ;帮助研究者鉴别和解释蛋白质序列信息, 研究分子进化、功能基因组。 它是一个全面的、经过注释的、非冗余的蛋白质序列数据库。 所有序列数据都经过整理,超过99%的序列已按蛋白质家族分类,一半以上还按蛋白质超家族进行了分类。;除了蛋白质序列数据之外,PIR还包含以下信息: (1)蛋白质名称、蛋白质的分类、蛋白质的来源; (2)关于原始数据的参考文献; (3)蛋白质功能和蛋白质的一般特征,包括基因表达、翻译后处理、活化等??? (4)序列中相关的位点、功能区域。; 一是基于文本的交互式查询, 用户通过关键字进行数据查询。 二是标准的序列相似性搜索, 包括BLAST、FastA等。 三是结合序列相似性、注释信息和蛋白质家族信息的高级搜索, 包括按注释分类的相似性搜索、结构域搜索等。;PIR主要数据库: ;主页的导航条有五大类: Abrout PIR:对网站的历史、发展、 刊物等的介绍; Databases:包括Proclass、Pirsf、PIR—PSD、 PIR—NREF 、Uniprot等数据库集合; Search/Analysis:对蛋白质序列分析的多种途径; Dowload:网站提供的蛋白质序列; Support

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