药效基团及三维结构数据库.pptVIP

药效团模建及三维结构数据库搜寻 ;§7.1 分子三维结构数据库简介 ; PDB结构库是药物设计的一个重要的结构来源 。可以直接从这儿得到生物大分子靶标的三维结构或高同源性蛋白的结构。 ;药效基团及三维结构数据库;§7.1.2 小分子数据库;( 一 ) 剑桥小分子数据库 ;药效基团及三维结构数据库;( 二 ) MDL数据库 ;（2） 药物数据报道三维结构数据库（MDDR-3D） ;（3）综合药物化学三维结构数据库（Comprehensive Medicinal Chemistry-3D） ;（4）NCI-3D数据库 ;（5）AIDS数据库 ;( 三 ) 天然产物数据库 ;;现有供虚拟筛选的商业化合物数据库 ;数据库名称;;§7.2 类药性分析 ; Lipinski对2245个WDI数据库中已经到达临床II期以上的药物分子的结构特征进行了系统的研究，提出了著名的预测化学物口服生物利用度的“五倍律”规则： ;类药性相关参数的范围 ;2.功能基团的方法 ; 药效基团过滤模型I （pharmcophore point fliter I）的方法用来区别药物和非药物分子，基本的规则包括： 1.药效基团连在一起或被少于两个重原子分开计数为一个； 2. 少于两个或多于七个药效基团的小分子无法筛选出来； 3. 吡咯和二嗪类除外的胺认为药效基团； 4. 剔除含多于一