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Revised by Petrel at 2021 Revised by Petrel at 2021 miRNA相关分析网站 miRNA数据库及靶基因分析软件 1.miRBase: HYPERLINK\t miRBase序列数据库是一个提供包括已发表的miRNA序列数据、注释、预测基因靶标等信息的全方位数据库，是存储miRNA信息最主要的公共数据库之一。miRBase提供便捷的网上查询服务，允许用户使用关键词或序列在线搜索已知的miRNA和靶标信息。 2.miRecords: HYPERLINK\t 动物mirna的靶相互作用的数据库,包括人工收集实验验证的,预测的miRNA的靶目标.靶标预测工具DIANA-microT,MicroInspector,miRanda,MirTarget2,miTarget,NBmiRTar,PicTar,PITA,RNA22,RNAhybrid,andTargetScan/TargertScanS. 3.PMRD:BioInformatics PMRD是一个关于植物microRNA数据库，包括了microRNA序列和它们的靶基因、二级结构、表达谱、基因组搜索等等，并且该数据库尝试着整合大量的关于植物microRNA的数据。 4.CoGeMiR: HYPERLINK\t CoGeMiR数据库总结关于在进化过程中microRNA在不同动物中的保守性。该数据库搜集已知的和预测的microRNA关于染色体定位、保守性和表达谱方面的信息。 5.MicroRNAdb: HYPERLINK\t MicroRNAdb是一个关于microRNA的综合性数据库。相比其他数据库，MicroRNAdb搜集的microRNA更完整且进行了充分的注释。如今，该数据库有732个microRNA序列的条目和439个详细的注释。 6.miRWalk: HYPERLINK\t miRWalkis是一个综合性数据库，提供来自人类、小鼠和大鼠的miRNA的预测信息和经过验证的位于其靶基因上的结位点。 7.TarBase: HYPERLINK\t TarBase数据库人工搜集了实验验证过的miRNA的靶基因，包括在人、小鼠、果蝇、蠕虫和斑马鱼中的miRNA的靶基因，区分出这些miRNA靶基因中的对的和不对的。 miRGator数据库是一个引导对miRNA进行功能阐释的工具。功能分析和表达谱结合靶基因预测，可以对miRNA的生物学功能进行推测。 miRGen是一个整合型数据库,包括：(i)动物miRNA和基因组元件之间的位置关系;(ii)通过结合广泛使用的靶基因预测程序得到动物miRNA靶基因。 miRNAMap数据库搜集了多个物种的经过试验证明的microRNA和miRNA靶基因，其中包括人类的、小鼠的、大鼠的以及其他多细胞动物的基因组。 Vir-Mir数据库提供预测的病毒miRNA的候选发夹结构序列。 ViTa数据库搜集来自miRBase、ICTV、VirGne、VBRC等数据库的病毒数据，包括了已知的病毒的miRNA以及相应的由miRanda和TargetScan预测的宿主miRNA靶基因。ViTa还提供有效的注释，包括人类miRNA的表达情况，病毒感染的组织等。 13.ASRP ASRP网站组织了拟南芥中的小RNA的信息，这些小RNA是通过ASRP或其他实验室分离得到的。 miRNApath是一个关于miRNA、靶基因以及代谢通路的的数据库。 miRex是一个分析microRNA基因表达的在线资源库，搜集，整理和分析已发表的关于microRNA基因表达的数据，它允许研究者通过数千数据点来分析基因表达和提供microRNA基因表达数据的在线保存。 自然产生的miRNA的靶标位点DNA变异的数据库. abioinformaticwebinterfaceabletocustomanalyzedeepsequencingdatatostudymiRNAvariantsorisomiRs.FromGeneticCausesofDiseaseGroup,GenesandDiseaseProgram,CentreforGenomicRegulation(CRG),PompeuFabraUniversity,Barcelona,Catalonia,Spain. 18.WMD3: HYPERLINK\t WMD3designsartificialmicroRNAs(amiRNAs).The21meramiRNA21merscanspecificallysilencegsingleor