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Western-Blot常见问题解析
Western-Blot常见问题解析
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Western-Blot常见问题解析
Western Blot常见问题解析
问题
可能原因
解决方法
凝胶未聚合。
单体纯度不够。
更换试剂。
凝胶溶液中,有溶解氧,抑制了凝胶聚合。
使用抽气泵抽出空气。
过硫酸铵实效或量不够。
应新鲜配制或换其他批号的过硫酸铵或增加溶液。
加入水层时凝胶已聚合。
聚合速度过快。
1.加催化剂之前,冷却凝胶溶液,让聚合速度减慢;
2.减少TEMED或过硫酸胺用量;
3.加快操作。
“微笑”(smiles)现象:即指示剂前沿呈现两边向上的曲线形。
凝胶冷却不均匀,中间部分冷却不好,致使凝胶中的分子有不同的迁移率。
更换凝胶。
“皱眉”(frowns)现象:即指示剂前沿呈现两边向下的曲线形。
常常是由于垂直电泳时电泳槽的装置不合适引起的,特别是凝胶和玻璃板组成的“三明治”底部有气泡或靠近隔片的凝胶聚合不完全。
更换凝胶
由于拔梳子时产生负压的缘故,造成浓缩胶和分离胶交界处分离,且加样孔底部开裂。
灌胶时梳子一定要是干燥的!梳子不要拔太快,可略左右晃动。
电泳时间比正常要长。
凝胶缓冲系统和电极缓冲系统的PH选择错误,及缓冲系统的PH和被分离物质的等电点差别太小或缓冲系统的离子强度太高。
更换缓冲液
沿指示剂向相反方向移动。
电源连接的正、负极错置或缓冲液选择错误。
检查电源连接的正、负极是否正确;
或更换缓冲液。
Western blot结果中背景高且不均匀。
使用的封闭液不兼容。
更换一种不同的封闭液。
膜封闭不够,非特异性位点封闭不足。
1、选择更加适合的封闭液;
2、提高封闭液中蛋白的浓度;
3、优化封闭时间和/或温度;
4、室温封闭至少1 h或者4°C封闭过夜。
抗体浓度太高。
一抗或二抗浓度太高会导致高背景,降低抗体浓度。
一抗孵育的温度偏高。
4℃孵育过夜。
抗体孵育不均匀。
在孵育过程中始终进行震荡。
洗涤不充分。
增加洗涤次数和使用缓冲液的体积。
缓冲液污染或结块沉淀。
制备新的缓冲液;缓冲液使用前过滤。
操作设备被污染。
保证电泳仪器、印迹仪器和孵育用容器清洁,无外缘污染物;保证在转膜后没有凝胶留在膜上,蛋白可能黏在胶上导致背景。
膜的曝光时间过久。
缩短印迹膜曝光的时间。
膜在实验过程中干过。
保证膜完全被液体覆盖,保证膜始终是湿润的,避免其干燥。
膜破损或污染。
小心夹膜:损坏膜可能导致非特异性结合;不能空手持膜,始终带干净手套或用镊子。
选择的膜容易产生高背景。
一般硝酸纤维素膜的背景会比PVDF膜低。
Western blot结果中杂带较多。
目的蛋白有多个修饰位点(磷酸化位点、糖基化位点、乙酰化位点等),本身可以呈现多条带。
查阅文献或进行生物信息学分析,获得蛋白序列的修饰位点信息,通过去修饰确定蛋白实际大小。
目的蛋白有其它剪切本。
查阅文献或生物信息学分析可能性。
样本处理过程中目的蛋白发生降解。
加入蛋白酶抑制剂;样本处理时在冰上操作。
上样量过高,太敏感。
适当减少上样量。
一抗或者二抗浓度偏高。
降低抗体浓度。
一抗特异性不高。
重新选择高特异性的抗体。
Western blot结果中信号弱或无信号。
蛋白未完全结合到膜上。
1.确保转膜过程中胶与膜完全接触;
2.确保转膜夹层排布正确;
3.确保按照膜的制造商的使用说明润湿膜;
4.确保转膜过程未过热;
5.优化转膜时间和电流;
6.在转膜缓冲液中加入20%的甲醇促进结合;
7.低分子量的抗原可能会穿过转印膜,需使用小孔径的膜进行。
抗体不足。
增加抗体浓度;抗体可能失活。
抗体浓度太高。
使用太多一抗或二抗可能导致信号迅速消失,呈现出很弱的信号。
抗原不足。
1.加入更多的蛋白进行跑胶;
2.抗原被封闭液掩蔽;
3.试用不同的封闭液;
4.优化封闭液中蛋白浓度。
缓冲液中含有叠氮钠。
叠氮钠是一种HRP的抑制剂,缓冲液不能使用叠氮钠作为防腐剂。
曝光时间太短。
延长曝光时间。
底物孵育时间太短。
进行5分钟的底物孵育。
底物失活。
重新加入底物;确保两种底物无交叉污染,两种底物试剂的污染可能导致活性下降。
膜可以修复剥离重新检测。
在膜剥离过程中可能会有抗原损失或变性,优化剥离程序;避免在同一张膜上重复进行检测。
在膜上消解抗原,封闭底物可能含有蛋白水解酶活性。
准备一张新的印迹膜。
印迹膜保存时蛋白降解。
准备一张新的印迹膜。
检测样本不表达目的蛋白。
选择表达量高的细胞作为阳性对照,用于确定检测样本是否为阴性。
检测样本低表达目的蛋白。
提高上样量,裂解液中注意加入蛋白酶抑制剂。
抗体不能识别测试种属的相关蛋白。
确定抗体是否能够交叉识别测试种属的对应蛋白
一抗孵育时间不足。
建议4℃孵育过夜。
二抗与一抗不匹配。
选
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