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癌症中基因环境的相互作用;基因决定论的局限;仅在少数情况下,基因通路与有机体的功能是完全特定的,如单基因疾病(镰刀型贫血症,muscle distrophy).此时,细胞没有其他的代偿途径,而环境的干扰为零---“一个突变基因--一种疾病模式”.; 一些数据;大约0.25%的女性携带易得病的BRCA1或BRCA2突变型,0.1%的人携带易得病的错配修复LOC1突变型.
这些基因型只能解释少于5%的乳腺癌或结肠癌.
20%的人携带阿朴脂蛋白E4的
等位基因,患Alzheimer氏病的RR
大约为2;而这个基因解释了16.7%
的Alzheimer氏病.;多少癌症可以归咎于基因诱因呢?;注意不同的危险度测量方式;当我们估计“筛选”的有效性时,必须考虑:;举例:
变异
有 无
检测
阳性 15 10
阴性 5 115
普遍性=20/145=13.8%
敏感性=15/20=0.75
特异性=115/125=0.92
阳性可预测值=15/25=0.60
即 100个阳性结果中有60个携带
该突变基因;;外显率有什么作用?;我们用计算机处理这些需要被处理的数据(筛选),即:需要通过筛选来预防某一种癌症的突变携带者的数目.
NNT(S)取决于外显率和预防措施的有效性.;在58%的成功率和37%的得病率的情况下,病例数下降了22%.
0.22的倒数约为4.5
在1.4%的得病率和58%的成功率的情况下,病例数下降了0.008,它的倒数是1/0.008=125
即:在第一种情况下我们需要处理4.5个对象,第二种则需要125个(NNT);现在我们可以将NNT与流行性相结合来获得NNS;案例2
如果我们在大众中筛选一个罕见的,高外显率的基因(NNT=4.5,流行性=0.16%,PPV=1.5%),为了预防癌症我们需要将NNT乘以流行性的倒数.
4.5*(1/0.0016)=2813个体(不考虑
个体敏感性与特异性)
;案例3
如果我们在家族中筛选一个罕见的,高外显率的基因(NNT=4.5,家族中的流行性=0.5),为了预防癌症我们需要将NNT乘以流行性的倒数.
4.5*(1/0.50)=90个体(不考虑个
体敏感性与特异性)
;在筛选大众中 低外显率基因(吸烟者的GSTM1),高外显率基因(BRCA1)或家族的情况下,计算数字需要筛选.
(摘自Vineis et al,The Lancet,357:709-712,2022)
肺癌 乳腺癌
暴露??PAH的 工人 BRCA1 BRCA1
GSTM1无效 GSTM1野生 大众 家族
RR 1.34(1.21-1.48) 1.0(a) 5 10
累计危险13% 10% 40% (b) 80%
危险下降50% 50%(c) 50%(它莫西芬 50%
或 Raloxifene )(d)
干涉后的
累计危险 6.5% 5% 20% 40%
绝对危险下降6.5% 5% 20% 40% ; 肺癌 乳腺癌
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