LAMMPS分子动力学技术与应用.pdfVIP

关于举办 “LAMMPS分子动力学技术与应用”培训班的通知 各有关单位 分子动力学模拟被广泛用于生命科学、化学工程、物理、医药、材料科学等领域。由于传统实验需要大 量的人力物力而且耗时，而计算机模拟的方法省时省力，能有效提高科研效率；目前，分子动力学模拟能 在很大程度上进行预测指导实验，因此模拟与实验的对照是将来研究的主要方向之一。分子动力学模拟作 为一种理想的计算机模拟方法，可以用来模拟两相之间的相互作用，也是对计算和实验的补充。应新老客 户的培训需求，北京软研国际信息技术研究院特举办 “LAMMPS分子动力学模拟技术与应用”培训班，本 次培训由互动派 （北京）教育科技有限公司具体承办，具体相关事宜通知如下： 一、 时间地点： 2018 年 11月 22 日——11月 25 日 北京 （时间安排：第 1天报到，授课 3天） 二、报名费用： 每人￥3300 元 （含报名费、培训费、资料费），食宿可统一安排，费用自理。 凡 11月9 日之前报名汇款的学员享受￥400元优惠 如需开具会议费的单位请联系招生老师要会议邀请函 三、培训特色： 1、小班授课，培训教室配备有服务器、投影； 2、对知识进行系统讲解，由浅入深，配合案例解析边讲边练，让学员能运用模拟软件针对每个技术点进行上机 操作；授课老师和助教现场解决学员提出的各种专业问题，针对性的分析学员需求并提供指导，从而更好地满足学员 不同方面的科研需求； 3、课堂上建立专属班级交流平台，学员学完后可以继续在班级群与老师同学交流问题，巩固学习内容。参加一 次培训，后期可以免费再参加一次。 四、联系方式： 联系人 凯军老师 电话 报名邮箱 ：chenkj112@ 报名 QQ 1090855036 官方网址： 分子动力学模拟交流大群 QQ群 668223348 北京软研国际信息技术研究院 互动派 （北京）教育科技有限公司 二零一八年十月十八日 二零一八年十月十八日 附件一： “LAMMPS分子动力学模拟技术与应用”培训班大纲 课 程 内 容 第一天 上午 课程 1 分子模拟理论 LAMMPS基础 1.1 基本假设；最速下降法；共轭梯度法 1.2 积分步长的选取；温度和压力控制；周期性边界条件; 分子动力学模拟流程 课程 2 LAMMPS操作基础 2.1 Linux 基础 2.2 LAMMPS 的 linux 版串行和并行及 GPU版编译安装 2.3 LAMMPS主要涉及的各种输入输出文件的介绍 In, data, lammpstrj 及 DCD, XTC 等格式的优劣，文件命名规则 2.4 LAMMPS力场介绍——深度探究力场具体形式，为以后创建自己体系做准备 力场的各种参数说明 （扩展 CVFF，MARTINI，CHARMM，AMBER等力场） 第一天 下午 实例操作：编译安装 LAMMPS LAMMPSS入门操作的 Linux 基础命令 课程 3 LAMMPS建模 3.1 建立各种体系模型(Packmol，Material Studio，VMD，gromacs 混合模型、界面模型、球体 模型等); 3.2 各种材料的 data 文件的建立，文件的结构以及参数说明 3.3 建立简单的有机物分子模型并集成为复杂的仿真模型 如何构建环氧树脂模型 （Material Studio），构建仿真模型 （vmd）。