引物设计流程之基因编码区CDS扩增引物设计.docxVIP

PCR引物设计流程 （以扩增鹅PHIP基因编码区序列为例） Primer 5设计引物 设计第一条引物 —?卜Hg。分析引物何省略） Blastn检测特异性 对照保守区域确定引物 二.确定模板 .确定模板来源物种 近亲物种：原鸡，绿头野鸭，鸽，雀，鹦鹉，蜂鸟等 常用物种：灵长类（人，大猩猩，恒河猴），哺乳类（大鼠，小家鼠，猪，牛，羊，狗），爬行类（鳄，龟）, 两栖类（蛙，蟾赊），鱼类（斑马鱼，亚马逊帆鱼） 一般在每一类常用物种中选择一个物种，在近亲物种中选择2种以上作为模板。如，扩增鹅PHIP基因选择以 下物种序列为引物设计模板：鸡，鸭，人，小鼠，蟾蛛，斑马鱼。 .利用NCBI得到各物种需扩增基