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R 语言主成分分析的案例
R 语言也介绍到案例篇了,也有不少同学反馈说还是不是特别明白一些基础的东西,希望能够有一些比较浅显的可以操作的入门。其实这些之前 SPSS 实战案例都不少,老实说一旦用上了开源工具就好像上瘾了,对于以前的SAS、clementine 之类的可视化工具没有一点感觉了。本质上还是觉得要装这个、装那个的比较麻烦,现在用R 或者 python 直接简单安装下,导入自己需要用到的包,活学活用一些命令函数就可以了。以后平台上集成R、python 的开发是趋势,包括现在 BAT 公司内部已经实现了。
今天就贴个盐泉水化学分析资料的主成分分析和因子分析通过R 语言数据挖掘的小李
子:
有条件的同学最好自己安装下R,操作一遍。
今有 20 个盐泉,盐泉的水化学特征系数值见下表.试对盐泉的水化学分析资料作主成分分析和因子分析.(数据可以自己模拟一份)
其中x1:矿化度(g/L)
导入数据保存在对象 saltwell
导入数据保存在对象 saltwell 中
saltwell-read.table(c:/saltwell.txt,header=T)
saltwell
x2:Br?103/Cl
x3:K?103/Σ 盐
x4:K?103/Cl
x5:Na/K
x6:Mg?102/Cl
x7:εNa/εCl.
1.
1.数据准备
2.
2.数据分析
标准误、方差贡献率和累积贡献率
arrests.pr- prcomp(saltwell, scale = TRUE)
summary(arrests.pr,loadings=TRUE)
每个变量的标准误和变换矩阵
prcomp(saltwell, scale = TRUE)
查看对象 arests.pr 中的内容
str(arrests.pr)
利用主成分的标准误计算出主成分的累积方差比例
cumsum(arrests.pr$sdev^2)/7
[1]0.6067060 0.7850968 0.9165341 0.9790524 0.9954128 0.9999024
1.0000000
各个化学成分占主成分的得分
arrests.pr$x
f.C I
PC2 m
FO` 阳25
”, I-I 心?”“°心-L l 5 3 钝?5
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