PAUP软件使用说明.docxVIP

PAUP 软件使用简要说明 数据输入格式 将需要分析的一组DNA 数据经Clustal 软件比对分析后，将其比对结果的*.aln 文件用Mega 软件打开并转换为Mega 格式（File-〉Convert To Mega Format），转换结果会以*.meg 文件存在与*.aln 同一目录下，再用 DNAsp 软件将*.meg 文件转换为 PAUP 格式（ File-〉Save/Export Date As，以 NEXUS File Format 保存）即可。 MP 法分析 先启动PAUP 软件，选择相应数据文件，然后在命令行内依次键入outgroup_外群名回车 Bootstrap_nr