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NIRS-KITV1.3
用户手册
2021年3月发布
认知神经科学与学习国家重点实验室
IDG/麦戈文脑研究所
北京师范大学,北京
NIRS-KIT用户手册
目 录
1 引言2
2 安装和启动3
2.1 安装要求3
2.2 安装3
2.3 启动3
3 NIRS-KIT概述5
4 任务态fNIRS数据分析6
4.1 数据准备6
4.1.1 时间信号的准备 (血红蛋白浓度)7
4.1.2 空间信息的准备 (光极放置)9
4.1.3 标准脑空间中空间信息的准备12
基于NFRI 的配准13
基于TBA 的配准14
4.1.4 NIRS-KIT数据输出格式和结构16
4.2 数据预览和质量检查16
4.3 预处理19
4.4 个体水平分析21
4.5 组水平统计26
4.5.1 单样本T检验27
4.5.2 双样本T检验28
4.5.2 配对样本T检验29
4.5.3 相关性分析29
4.5.4 单因素方差分析30
4.5.5 平均31
4.6 结果可视化31
4.6.1 2D结果可视化32
4.6.2 3D结果可视化33
5 静息态fNIRS数据分析36
5.1 数据准备37
5.2 数据预览和数据质量检查37
5.3 预处理38
5.4 个体水平分析38
5.5 组水平统计45
5.6 结果可视化45
参考文献54
1
NIRS-KIT用户手册
1 引言
NIRS-KIT (Hou et al.,2021)是一个基于MATLAB 的跨平台工具箱,用于任
务态和静息态fNIRS数据分析,具有用户友好的GUI。该工具箱包含了整个数
据分析流程,包括原始数据格式转换、数据预览和数据质量检查、预处理、个
体水平分析、组水平统计和结果可视化。
该工具箱已在安装了MATLAB 的各种操作系统下成功测试,包括Windows、
Linux和MacOS系统。
参考文献:
Hou,X.,Zhang,Z.,Zhao,C.,Duan,L.,Gong,Y.,Li,Z.,Zhu,C.,2021.NIRS-KIT:aMATLAB
toolbox forbothresting-state andtask fNIRSdataanalysis.Neurophotonics8.
/10.1117/1.NPh.8.1.010802
Copyright ©2019,Xin Hou,ZongZhang,ChaozheZhu.NationalKey Laboratory ofCognitive
NeuroscienceandLearning,IDG/McGovern Institute for Brain Research,BeijingNormal
University,Beijing, 100875,China.
联系方式:houxin195776@
2
NIRS-KIT用户手册
2 安装和启动
2.1 安装要求
Matlab:MatlabR2012a或更高版本;
NIRS-KIT:下载网址:/projects/nirskit/;
SPM12:如果Matlab搜索路径中没有SPM12 (可以在Matlab 命令窗口中键
入 “which spm”进行确认),需要添加;
下载网址:https://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/software/spm12/。
2.2 安装
-解压NIRS-KI
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