转录因子蛋白在DNA上的运动过程分析方法和装置.pdfVIP

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2023-05-09 发布于北京
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转录因子蛋白在DNA上的运动过程分析方法和装置.pdf

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本发明提供了一种转录因子蛋白在DNA上的运动过程分析方法和装置。所述方法包括获取WRKY结构域蛋白在DNA双链上运动的全原子MD模拟轨迹作为初始路径；从初始路径中均匀提取出若干帧的WRKY结构域蛋白与DNA的构象作为第一构象；计算均方根距离以及旋转角度，利用K‑means算法对第一构象进行聚类，进行第一轮MD模拟，得到第二构象；利用K‑centers算法对第二构象进行聚类，在广泛空间中进行第二轮MD模拟，得到第三构象；构建马尔可夫态模型，对第二轮MD模拟轨迹进行分析。以此方式，可以在实验测量下直

(19)国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 114496103 A (43)申请公布日 2022.05.13 (21)申请号 202210128910.2 (22)申请日 2022.02.11 (71)申请人北京帝测科技股份有限公司地址 1