基于高斯混合图变分自编码器的深度无监督单细胞聚类方法.pdfVIP

基于高斯混合图变分自编码器的深度无监督单细胞聚类方法.pdf

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本发明公开一种基于高斯混合图变分自编码器的深度无监督单细胞聚类方法,使用蛋白质‑蛋白质相互作用关系PPIs(或调控元件相互作用HiChIP)初始化基因调控网络A;使用K‑means方法初始化每个细胞的细胞聚类C;令基因调控网络A、单细胞基因表达数据X(或调控元件开放程度数据X)通过图编码器得到隐层;获得细胞聚类C,从高斯混合模型GMM中采样得到细胞低维表示Z:使用解码器预测基因调控网络A;计算损失函数,反向传播更新A、GCN,重复上述步骤,直至收敛;输出基因调控网络A,细胞低维表示Z,细胞聚类C

(19)国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 114783526 A (43)申请公布日 2022.07.22 (21)申请号 202210506799.6 G06N 3/08 (2006.01) (22)申请日 2022.05.1

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