基于氨基酸序列比对的蛋白家族系统发育分析方法.pdfVIP

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2023-05-19 发布于北京
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基于氨基酸序列比对的蛋白家族系统发育分析方法.pdf

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本发明公开了一种基于氨基酸序列比对的蛋白家族系统发育分析方法，包括以下步骤：基于氨基酸序列比对融合方法，获得合并的多序列比对结果；对合并的多序列比对结果进行数字化，构建分数矩阵；对分数矩阵进行降维、聚类处理，获得输入序列；鉴定输入序列的特异位点及保守位点；对输入序列进行拟时间分析，获得输入序列的轨迹排序；基于轨迹排序，获得输入序列的发育轨迹。本发明通过序列位点特征进行分数矩阵构建及其降维分析，从而推断基因家族间的聚类和进化关系，在保证序列聚类稳定性的情况下，有效提高了序列基因聚类速度，为基因系统

(19)国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 114882949 A (43)申请公布日 2022.08.09 (21)申请号 202210749152.6 (22)申请日 2022.06.29 (71)申请人华中农业大学地址 430070