第4章 生物信息的传递 从mRNA到蛋白质;4.3 核糖体的结构与功能 ;核糖体的组成;
原核和真核生物核糖体的组成及功能
核糖体亚基 rRNAs 蛋白 RNA的特异顺序和功能
细菌
70S 50S 23S=2904b 31种(L1-L31)含CGAAC和GTψCG互补
2.5×106D 5S=120b
66%RNA 30S 16S=1542b 21种(S1-S21) 16SRNA(CCUCCU)和S-D
顺序(AGGAGG)互补
哺乳动物
80S 60S 28S=4718b 49种 有GAUC和tRNAfMat的TψCG互补
4.2×106D 5S=120b
60%RNA 5.8S=160b
40S 18S=1874b 33种 和Capm7G结合
?;(二)核糖体的功能;核糖体上,可分多个功能活性中心,
有专一的识别作用和功能。
●mRNA结合部位——小亚基
●结合AA-tRNA部位(A位)——大亚基
氨酰tRNA结合位点
●去氨酰tRNA结合位点和脱离位点(E位)——大亚基
●肽基转移部位(P位)——大亚基
肽酰tRNA结合位点
;3个tRNA结合部位;4.4 蛋白质合成的过程;20种基本氨基酸的分类概图;4.4.1氨基酸的活化;氨基酰-tRNA合成酶对底物氨基酸和tRNA都有高度特异性。
氨基酰-tRNA合成酶具有校正活性
氨基酰-tRNA的表示方法:
Ala-tRNAAla
Ser-tRNASer
Met-tRNAMet ;氨基酰-tRNA合成酶校正活性;原核生物中,起始氨基酸是:甲酰甲硫氨酸
起始AA-tRNA是: fMet-tRNAfMet
真核生物中,起始氨基酸是:甲硫氨酸
起始AA-tRNA是: Met-tRNAMet;第一步反应;第二步反应; tRNA与氨基酰-tRNA合成酶结合的模型;(二)翻译的起始;S-D序列 ;Kozak序列:扫描序列,真核起始码子上下游的保守序列,用于吸引核糖体沿着5‘-3’方向滑动(kozak扫描)找到起始密码子的帽子结构序列。
最佳序列为:-3位为嘌呤碱基;+4位为G,起始密码子AUG中的A处于+1位。
;Kozak扫描模型 解释了 小亚基与mRNA的识别过程;IF-3;1-2、30S小亚基通过SD序列与mRNA模板相结合。;IF-3;IF-3;IF-3;真核生物翻译起始的特点(与原核的差异);; 肽链延伸由许多循环组成,每加一个氨基酸就是一个循环,每个循环包括:AA-tRNA与核糖体结合(进位)、 肽键的生成(成肽) 和 移位。
延伸因子(elongation factor, EF) :
原核生物:EF-T (EF-Tu, EF-Ts)
EF-G
真核生物:EF-1 、EF-2 ;延伸第一步:进位:AA-tRNA与核糖体A位点的结合;通过延伸因子EF-Ts再生GTP,形成EF-Tu?GTP复合物 ;延伸第二步:肽键形成是由转肽酶/肽基转移酶催化;延伸第三步:移位;延长因子EF-G有转位酶( translocase )活性,可结合并水解1分子GTP,促进核蛋白体向mRNA的3侧移动 。;;;移位;;原核肽链合成终止过程 ;终止因子的类型;4.4.5 蛋白质前体的加工;2、二硫键的形成
两个半胱氨酸-SH -SH -SH 二硫键;4、切除新生肽链中非功能片段;5. 蛋白质的修饰;;是一种更高级的加工;1. 酶:二硫键异构酶、脯氨酰顺反异构酶
2. 分子伴侣:由若干在结构上不相关的蛋白质家族组成,但它们具有共同的功能,在细胞内帮助其他多肽链的结构完成正确的组装,而且在组装完毕后与之分离,不构成这些蛋白质在执行功能时的结构组分。;几种有促进蛋白折叠功能的大分子;一、分子伴侣;1 热休克蛋白促进蛋白质折叠的基本作用——
结合保护待折叠多肽片段,再释放该片段进行折叠。形成HSP70和多肽片段依次结合、解离的循环。
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