热点残基和靶点蛋白复合物结构的生成方法及装置.pdfVIP

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2023-05-20 发布于北京
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热点残基和靶点蛋白复合物结构的生成方法及装置.pdf

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本申请涉及一种热点残基和靶点蛋白复合物结构的生成方法及装置。该方法包括：将丙氨酸的原子坐标调整至靶点蛋白的特定表位区域后，在丙氨酸的两端分别延伸一个甘氨酸，形成初始三肽结构；将初始三肽结构中的丙氨酸分别突变为天然氨基酸或D型构象的天然氨基酸，获得对应的突变三肽结构；根据第一预设打分函数对突变三肽结构的骨架二面角随机赋值，获得对应的打分值并筛选获得候选三肽构象；候选三肽构象在靶点蛋白的特定表位区域中的局部区域进行分子对接，获得候选三肽与靶点蛋白的结合构象，并筛选获得结合自由能最低的优选三肽与靶点蛋

(19)国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 114927160 A (43)申请公布日 2022.08.19 (21)申请号 202210616239.6 (22)申请日 2022.03.03 (62)分案原申请数据 202210203337.7