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本发明公开了一种基于NGS测序技术精准组装叶绿体基因组的方法,步骤如下:S1、利用illumina测序技术对样品进行测序;S2、下载NCBI数据库中所有叶绿体基因组序列构建本地参考数据库;S3、将测序数据比对步骤2构建的数据库,筛出叶绿体数据;S4、使用spades软件对步骤S3得到的数据进行初步组装,得到contigs序列;S5、将步骤S4得到的contigs序列进行自身比对,将有相似性的contigs去冗余;S6、对剩余的contigs序列挑选最长的1条进行reads比对迭代延伸,在延伸过程
(19)中华人民共和国国家知识产权局
(12)发明专利申请
(10)申请公布号 CN 112481387 A
(43)申请公布日 2021.03.12
(21)申请号 202011317707.7
(22)申请日 2020.11.23
(71)申请人 南京集思慧远生物科技有限公司
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