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公开一种基于小样本的多组学数据中基因型与表型关联分析方法,具体包括下列步骤:利用蛋白质网络和基因表达值生成带权无向基因关联图,并利用SPICi聚类方法对该无向图进行聚类,生成基因簇;利用groupLasso方法对基因簇进行筛选;通过eQTL数据得到筛选后的基因簇所对应的SNP簇;将每个SNP簇、所对应的基因簇及表型构建为一个三层网络类块,对每个类块中SNP与基因关联关系采用稀疏偏最小二乘方法进行回归运算,对基因与表型关联关系采用逻辑回归进行运算;对各类块所得预测结果求平均,得到最终预测结果。本
(19)中华人民共和国国家知识产权局
(12)发明专利
(10)授权公告号 CN 113192556 B
(45)授权公告日 2022.04.26
(21)申请号 202110288323.5 (56)对比文件
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