用于散列表基因组映射的灵活种子延伸.pdfVIP

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  • 2023-07-06 发布于四川
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用于散列表基因组映射的灵活种子延伸.pdf

本发明公开了用于生成和使用被配置为改进读段映射的散列表的方法、系统和装置,包括计算机程序,该方法、系统和装置包括:从参考序列获得K个核苷酸的第一种子,生成具有节点的种子延伸树,其中该节点中的每个节点对应于(i)延伸种子,该延伸种子是第一种子的延伸并具有K*的核苷酸长度,和(ii)种子延伸表中的一个或多个位置,该一个或多个位置包括描述与该延伸种子匹配的参考序列位置的数据,并且对于每个节点:在该散列表的对应于延伸种子的索引键的位置存储区间信息,其中该区间信息引用该种子延伸表中的一个或多个位置,该一个

(19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 113826168 A (43)申请公布日 2021.12.21 (21)申请号 202080003658.1 (74)专利代理机构 广州三环专利商标代理有限

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