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生物信息学中的几个计算问题 举例： Vertex cover motif finding DSSP (Distinguishing String Selection Problems) 计算机的计算能力全文共52页，当前为第31页。 一、Vertex cover DNA sequences A,G,T,C代表四个DNA的基本元素 105个互不相同的DNA序列 G A T T C C A G T…………………………………… 计算机的计算能力全文共52页，当前为第32页。 Give n(here,n= 105) DNA sequences, can you find 60 of them whose remove makes the remaining sequences consistent? 问题：105个基因序列中,只去掉60个,使得剩下的序列相似. 计算机的计算能力全文共52页，当前为第33页。 模型： 作一个图，每个DNA串是图中的一个点。 两个串比较，不相同的话加一条边进行连接，每条边对应两个不同的DNA。移除边上的任意一点相当于删除这条边。 这个图上的信息量可以用计算机来计算，大约为10万的平方。 在图中找到60个点后就没有边了