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本发明提出一种基于细胞动态分化的基因调控网络构建方法,该方法包括,获取单细胞转录组测序数据并进行预处理,再利用Slingshot进行推断,得到包含细胞注释信息和拟时间信息的表达矩阵;根据表达矩阵中拟时间信息的密度计算两种细胞状态之间的交点,以交点为基准,将所有细胞划分成多个窗口;在每个窗口中构建细胞类型特异性基因调控网络;构建参考网络,将参考网络作为参考信息来校准细胞类型特异性基因调控网络。本发明将拟时间信息和细胞类型结合,并且考虑了细胞密度沿拟时间的分布状况,有助于从细胞动态分化的角度构建细胞
(19)国家知识产权局
(12)发明专利申请
(10)申请公布号 CN 116504314 A
(43)申请公布日 2023.07.28
(21)申请号 202310765180.1
(22)申请日 2023.06.27
(71)申请人 华东交通大学
地址 330000
原创力文档


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