一种基于比较基因组学的转座子插入多态TIP分子标记的挖掘方法.pdfVIP

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2023-07-29 发布于四川
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一种基于比较基因组学的转座子插入多态TIP分子标记的挖掘方法.pdf

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本发明公开了一种基于比较基因组学的转座子插入多态TIP分子标记的挖掘方法，包括以下步骤：（1）选取目标基因或待研究的基因组片段为参考序列。（2）将参考序列在NCBI的WGS数据库中猪的基因组测序数据进行Blast比对，获取不同品种基因组中的同源序列，并对上述序列进行手动校对和拼接。（3）根据猪转座子数据对参考序列和拼接序列进行转座子注释以及多序列比对。（4）挑选序列间存在的超过100个碱基且对应转座子的Indel位点，作为候选TIP位点。（5）以不同品种的池DNA为模板进行PCR扩增检测，选取带

(19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 110257481 A (43)申请公布日 2019.09.20 (21)申请号 20191