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硅胶膜型质粒DNA小量提取试剂盒
硅胶膜型质粒DNA小量提取试剂盒
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硅胶膜型质粒DNA小量提取试剂盒
硅胶膜型?质粒DNA小量提取试剂盒
操作方法
将3~5ml菌液13,000rpm离心30秒采集积淀(菌体)。假如用1.5ml或2ml离心管则需频频离心2~3次。
倒掉上清,将积淀(菌体)完整悬浮于100μl悬浮液(溶液I)中。上清要尽可能去除洁净,可用滤纸吸干。积淀要用混旋器完整悬浮,不然将直接致使下一步的裂解不完全,从而影响质粒DNA的产量和纯度。
加入150μl裂解液(溶液II),柔和地颠倒混匀10次左右,溶液渐渐变得黏稠、清明。
不行用混旋器强烈振荡,不然会使质粒DNA断裂;裂解时间不宜超出5分钟,不然会造成染色体DNA的污染。
加入150μl中和液(溶液III),柔和地颠倒混匀10次左右。
此时可见到白色絮状的染色体DNA及细菌碎片。
5.13,000rpm离心8~10分钟,将上清液当心转移入一个新的1.5ml离心管中,
加入等体积(约
400μl)的联合液,颠倒混匀。
6.将混和液吸入离心纯化柱中,静置起码3分钟,13,000rpm离心30秒,倒掉
采集管中的废液。
此步使处于高盐状态下的质粒DNA与硅胶膜联合后,离心去除杂质。
7.将离心纯化柱从头套入废液采集管中,加入600μl80%异丙醇(或80%乙醇),
13,000rpm离心1分钟,倒掉采集管中的废液。
假如离心纯化柱底部残留有异丙醇(或乙醇),可用滤纸吸干,不然将影响以
后的酶促反响。此步是清洗质粒DNA中混有的杂质及盐类。
重复第7步一次,尽可能将杂质及残留的乙醇去除。
9.拿出离心纯化柱,将其套入一个洁净的1.5ml离心管,开盖搁置2~3分钟,
使乙醇充分挥发洁净。加入50μlTE缓冲液(若用于测序,则加50μl超纯水)
于硅胶膜上,不可以粘在管壁上。室温下搁置5分钟后,13,000rpm离心1分
钟。
离心柱放入离心管中,若盖不上盖子,亦没相关系,可开盖离心。TE缓冲液
或无菌超纯水的用量视用户对浓度的要求而定。
将洗脱液从头吸入离心纯化柱中,再洗脱一次。这样能够获取较高产量的质
粒DNA。
11.离心管中采集的液体即是洗脱下来的质粒DNA,取1~2μl电泳(0.8%琼脂糖,
120V,15~20分钟)检测其纯度并目测定量。
若发现有RNA污染,可加入0.5μlRNaseA(10mg/ml),37℃保温30分钟。此
操作不影响后来续实验。
增补说明
※假如开端菌液体积较大或采集的菌体许多,溶液I、II、III的用量及其余试剂可
相应放大。但操作略有不一样,需要时我们乐于供给帮助。
※实考证明,少许的RNA污染关于酶切、转变及测序无显然的影响。
常有问题及参照建议
常有问题可能原由参照建议
质粒产量低细胞裂解不充分减少培育物体积。关于高拷贝质粒,培育
物体积不要超出5ml,低拷贝质粒培育物体
积不要超出10ml
按比率增添溶液I与溶液II的体积,使菌体
充分悬浮,而后完整裂解细胞
非转变细胞的大批生长一定在选择条件下扩增质粒DNA
定量不正确经过琼脂糖凝胶电泳进行察看及定量
不适合的保留条件
将质粒DNA溶于无菌超纯水或TE中,于
-20℃保留
菌液培育的时间过长
在新鲜的选择平板上精选一个分开优秀的
单菌落,于37℃振荡培育12~16小时
质粒的拷贝数太低
增添培育物体积,但不要超出10ml
溶液II及联合液有结晶出
将溶液II及联合液置于37℃温浴30min以
现
上,使结晶完整溶解,且在使用前要充分
混匀
洗脱温度过低
加入无菌超纯水或许TE浸透硅胶膜后,于
37~50℃温育2分钟
洗脱液pH7.0
用TE或pH7.0的无菌超纯水洗脱
洗脱液中没
质粒DNA漂出点样孔
增添甘油或蔗糖助沉
有质粒DNA
质粒丢掉
在新鲜的选择平板上精选生长优秀的单克
隆进行细菌培育
对证粒DNA进行从头转变
杂菌污染
在选择平板上精选生长正常的菌落进行摇
菌
电泳时质粒
开环质粒DNA及线状质
加入裂解液后,轻轻混匀,时间不要超出
体现额外条
粒DNA的存在
5min
带
可能存在缺失突变体
有些质粒如cosmids长久保留于E.coli中是
不稳固的,在摇菌时应在选择平板上精选
新鲜的,分开优秀的单克隆
电泳时质粒
存在质粒多聚体
单酶切后,质粒多聚体酶切为线状质粒
体现额外条
DNA,可与染色体DNA的污染相差别
带
存在变性的超螺旋质粒
加入裂解液(溶液II)后,碱裂解时间不要
DNA
超出5分钟
RNA污染
菌体过度,致使RNaseA
减少培育菌液的体积
相对量不足
溶液I搁置时间超出
6个
于100μl溶液I中加入1μlRNase(A10mg/ml)
月
或于洗脱液中加入0.5μlRnaseA,37℃温育
30min以上
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