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副鸡禽杆菌体内诱导基因的筛选研究的中期报告
本研究旨在筛选出副鸡禽杆菌体内诱导基因,以揭示其在菌体生长和病原性中的作用。该中期报告主要介绍研究的进展和初步结果。
研究进展:
1. 建立诱导体系:在前期实验中,我们通过长时间培养、低温和多种胁迫条件下诱导菌体,最终确定了较为适宜的诱导体系——将副鸡禽杆菌在37°C的LB培养基中培养至对数生长期后添加0.1 mM IPTG,在37°C下继续培养4小时,将得到较为理想的诱导效果。
2. 构建文库:利用以上诱导体系,采用高通量测序技术对诱导前后的菌体进行RNA测序,得到大量的转录本数据。我们将这些转录本数据构建为文库,为后续筛选工作提供了基础数据。
3. 筛选工作的开展:针对上述文库,我们采用两种方法筛选体内诱导基因。一种是基于比较分析的方法,即将诱导前后的转录本数据进行比较,找出在诱导后有显著表达变化的基因;另一种是基于高通量筛选技术的方法,即将文库进行大规模筛选,筛选出差异表达的基因。
初步结果:
经过比较分析,我们已初步筛选出了一部分在体内诱导表达显著提高的基因,其中包括多种代谢相关基因和致病相关基因。通过大规模筛选,我们也已发现一批差异表达基因,并正在进一步鉴定其功能和参与的代谢途径或信号通路。
结论:
中期报告显示,我们已初步建立了副鸡禽杆菌体内诱导基因的筛选体系,并初步获得了一批体内诱导的基因。下一步工作将进一步优化筛选方法,深入分析所获得的基因,并以此探究副鸡禽杆菌的致病机理。
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