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斜带石斑鱼IL-8及其受体基因的克隆、表达的中期报告
该研究以斜带石斑鱼(Epinephelus coioides)为模式动物,针对其免疫应答相关的信号转导分子——白细胞介素-8(Interleukin-8, IL-8),进行了基因克隆及表达分析。
首先,通过生物信息学手段,从鳞片细胞转录组中筛选得到了一条完整的斜带石斑鱼IL-8基因序列,大小为858 bp,包含一个开放阅读框(ORF),编码了一个287个氨基酸的蛋白质,其中含有一个信号肽和一个成熟肽。通过同源性比对和进化分析发现,该基因与其他物种IL-8具有高度保守性,并且在进化树上与其他鱼类IL-8聚为一类,进一步确定其属于鱼类IL-8家族。
为了探究斜带石斑鱼IL-8基因的表达特点,研究人员设计了一系列引物以及不同免疫刺激条件的处理方法,包括细菌多糖LPS、人工合成的CpG寡核苷酸以及细胞外信号分子脂多糖(Lipopolysaccharide, LTA),并利用实时荧光定量PCR技术(Real-time Fluorescence Quantitative PCR, RT-qPCR)检测了IL-8基因在不同组织(肝脏、脾脏、肌肉、肾脏、心脏、鳃)及刺激条件下的转录水平。初步结果表明,在正常生理状态下,IL-8基因在斜带石斑鱼不同组织中的表达量存在差异,其中以肝脏和脾脏表达量较高。另外,在免疫刺激后,该基因的表达水平明显上调,其中以LPS刺激后的表达水平最高。
此外,研究人员还通过同源性分析获得了斜带石斑鱼IL-8的两种潜在受体基因序列,分别为CXCR1和CXCR2。当前,该研究正在进一步探究这两个基因在斜带石斑鱼免疫系统中的作用及表达水平等特点。
综上,该研究首次对斜带石斑鱼IL-8基因进行了克隆与表达分析,初步确定了其基因序列及表达特点,并为进一步探究其在免疫应答中的作用及机制奠定了基础。
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