髓母细胞瘤差异表达microRNA的筛选及功能预测的中期报告.docxVIP

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  • 2023-10-08 发布于上海
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髓母细胞瘤差异表达microRNA的筛选及功能预测的中期报告.docx

髓母细胞瘤差异表达microRNA的筛选及功能预测的中期报告 髓母细胞瘤(medulloblastoma)是一种儿童常见的恶性肿瘤,具有高度异质性。鉴于microRNA(miRNA)在肿瘤发生发展过程中的重要作用,本研究旨在筛选差异表达miRNA并预测其功能,进一步探究髓母细胞瘤的发生发展机制。 首先,我们从公开数据库GEO中下载了3个髓母细胞瘤组织和3个正常小脑组织的miRNA表达数据。使用R语言的edgeR包对这些miRNA表达数据进行了差异表达分析,发现了466个差异表达miRNA。经过进一步筛选,得到了10个差异表达miRNA(包括miR-10b、miR-21、miR-34a等),它们的差异表达在各组样本之间具有显著性差异。 接着,我们对这10个差异表达miRNA进行了GO(Gene Ontology)和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)通路分析。这些miRNA可能参与了多种生物学过程,如细胞周期、信号转导、细胞凋亡等。在KEGG通路分析中,miRNA-mRNA调控网络的结果表明,这些miRNA可能与神经退行性疾病、癌症、免疫系统等多个疾病相关的通路有关。 最后,我们使用TargetScan和miRWalk等在线工具预测这些miRNA的靶基因,并对这些预测结果进行了基因集富集分析。预测结果显示,这些miRNA目标基因可

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