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本发明提供一种宏基因组结构变异自动化分析方法及装置,包括:读取待分析测序数据,建立软链接;对待分析测序数据进行质量控制;去除数据中的宿主reads;基于去除宿主reads的数据,进行基因组组装;对组装后的基因组进行bins分箱,得到基于宏基因组组装的MAGs;将MAGs合并并去重;对去重后的MAGs进行物种注释并进行基因预测;检测发生SV事件的MAGs;将去重后的MAGs进行功能注释;以发生SV事件的MAGs的基因作为前景基因集,以经过功能注释的MAGs的基因作为背景基因集,进行KEGG富集分析
(19)国家知识产权局
(12)发明专利申请
(10)申请公布号 CN 116884480 A
(43)申请公布日 2023.10.13
(21)申请号 202310630229.2
(22)申请日 2023.05.30
(71)申请人 中国科学院微生物研究所
地址 1
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