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- 2023-10-18 发布于河北
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schrodinger分子对接流程
Schrodinger分子对接流程如下:
蛋白和小分子预处理:用LigGprep模块对小分子进行能量最小化,生成3D构象;用Protein Preparation Wizard模块对受体蛋白进行处理,结束后左侧会生成处理后结果。
生成grid结合口袋:用Receptor Grid Generation模块,选择Molecule,再点选下展示窗口的小分子。
分子对接:用Ligand Docking模块,选择加载口袋zip文件,再选择需要对接的优化过的配体,进行对接。
对接结果展示:
Ligand Docking模块对接打分,分数越高,表示对接越好。
每个配体对接能量优化循环次数。
每个配体的对接构象。
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