耐辐射奇球菌抗辐射相关ncRNA的筛选验证和功能研究的中期报告.docxVIP

耐辐射奇球菌抗辐射相关ncRNA的筛选验证和功能研究的中期报告 本项目旨在筛选出耐辐射奇球菌中与抗辐射相关的非编码RNA（ncRNA），并鉴定其在细胞的功能。目前已完成了该项目的中期报告，以下是报告的主要内容： 1. 实验设计 本项目分为两个阶段：初筛和深度筛选。在初筛阶段，我们通过高通量测序技术对耐辐射奇球菌中的ncRNA进行了筛选，得到了一组候选的ncRNA。在深度筛选阶段，我们将利用RNAi技术沉默这些ncRNA的表达，并评估它们对细胞耐受辐射的影响。同时，我们也将利用3末端连接反转录PCR技术扩增出各候选ncRNA的全长，并通过RNA pull-down实验鉴定它们与哪些蛋白质具有相互作用。 2. 进展情况 在初筛阶段，我们成功地分离出了耐辐射奇球菌中的ncRNA，并进行了高通量测序。通过比较分析，共筛选出了一组候选的ncRNA。这些ncRNA的读数覆盖范围广、丰度高、差异显著，表明这些ncRNA可能在耐辐射奇球菌的抗辐射机制中发挥着重要的作用。 在深度筛选阶段，我们已经开始了RNAi沉默试验。我们将分别合成siRNA并转染到耐辐射奇球菌中，以沉默这些ncRNA的表达。同时，我们也正在利用3末端连接反转录PCR技术扩增出各候选ncRNA的全长，并设计引物进行鉴定。目前已经扩增出了一批ncRNA的全长，并准备进行RNA pull-down实验。 3. 下一步计划 在深度筛选阶