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应用OWLS研究靶序列二级结构对固液界面NDA杂交动力学的影响的中期报告
本次研究旨在探究靶序列二级结构对固液界面核酸杂交动力学的影响。本中期报告主要介绍了研究的实验设计和初步结果。
实验设计:
我们选取了两个靶序列,分别为直链和环形,它们的长度均为15个核苷酸。同时选择了两种探针序列,它们的长度为20个核苷酸,其中探针序列1与直链靶序列完全匹配,探针序列2与直链靶序列有一处错配。我们通过阴离子表面改性法制备了固液界面样品,然后利用能量色散 X 射线衍射(EDXD)技术进行了表征。
初步结果:
我们观察到,与环形靶序列相比,直链靶序列更容易形成二级结构,在EDXD图谱中显示出更明显的峰。当探针序列1与直链靶序列杂交时,出现了一个明显的峰,说明杂交反应成功。探针序列2和直链靶序列杂交后,虽然也出现了一个小的峰,但是峰的强度明显较弱,表明杂交效率较低。
结论:
本次研究表明,靶序列的二级结构对固液界面核酸杂交反应具有显著的影响。下一步,我们将进一步优化实验条件和方案,深入探究二级结构对杂交反应的影响机制。
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