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基于非参数模型的酵母基因转录起始位点的统计分析的中期报告 酵母基因转录起始位点(TSS)的预测和注释是酵母遗传学研究中的重要一环。传统方法通常基于先验假设，并且对数据的分布有所限制。而非参数模型则无需先验假设，可更准确地描述数据分布。本项目目的在于探究基于非参数方法的酵母基因TSS的统计分析。 迄今为止，我们完成的工作包括： 1. 数据预处理：我们使用基因组学实验技术鉴定了S. cerevisiae的转录因子结合位点。这些位点对我们预测TSS非常有帮助。我们还在UCSC的数据库中下载了酵母基因组序列和注释信息。在此基础上，我们针对每个基因的信号峰，确定了其转录起始位点。 2. 构建非参数模型：为了更准确地描述基因的TSS分布，我们采用了非参数方法。我们使用核密度估计(kde)函数，对TSS分布进行建模，并使用交叉验证等技术选择出最佳的带宽参数。 3. 模型评估：我们使用两种方法评估模型的性能。第一种方法是使用对数损失函数，将模型预测值与实际值进行比较。第二种方法是使用平均绝对误差来比较模型的预测误差。 目前，我们已经在实验集上测试了我们的模型，并得到了相对较好的结果，包括对数损失和平均绝对误差。接下来，我们计划在大规模的测试集上评估模型的性能，并尝试将其与传统方法进行比较。我们还将进一步优化模型，以获得更好的性能。