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陆地棉棉籽蛋白质含量、油份含量近红外分析模型的建立及其QTL的筛选、定位的中期报告
该研究旨在建立陆地棉棉籽蛋白质含量和油份含量的近红外(NIR)分析模型,并通过QTL分析筛选和定位这些性状的潜在基因。
在本研究中,使用亚洲和非洲陆地棉材料的谷粒近红外光谱和实验室测定的蛋白质和油份含量进行建模和验证。首先,使用试波前处理方法对光谱进行了预处理,然后使用主成分回归(PCR)和偏最小二乘回归(PLS)算法建立了蛋白质含量和油份含量的近红外分析模型。使用交叉验证和外部验证方法评估了这些模型的预测性能。
结果显示,PCR和PLS模型都对蛋白质和油份含量具有较好的预测性能,其中PLS模型表现更佳。对于蛋白质含量,PLS模型的预测误差为0.64%(标准误差为0.05),确定系数为0.82;对于油份含量,PLS模型的预测误差为0.69%(标准误差为0.06),确定系数为0.79。这些结果表明,NIR技术可以用于陆地棉的蛋白质和油份含量的快速、非破坏性测量。
在筛选和定位蛋白质和油份含量的QTL方面,本研究使用基于群体的关联分析(GWAS)和QTL分析技术对亚洲陆地棉材料进行了分析。在这项工作中,我们已经完成了所有的分子标记鉴定和基因表达位点的测量,并开始进行基因型与表型数据之间的连锁不平衡分析。
总的来说,这项研究为陆地棉棉籽蛋白质和油份含量的快速、非破坏性测量以及相关QTL的筛选和定位提供了一种新的方法。我们期望在未来的研究中,通过更广泛的材料集合和更严格的分析方法,能够进一步优化这些分析模型,并确定这些性状的潜在遗传机制。
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