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ICS?65.020.01
B?16
DB12
天 津 市 地 方 标 准
DB12/T?1006—2020
茄子黄萎病菌土壤带菌?PCR?检测技术规程
Technical?regulation?of?PCR?detection?for?verticillium?dahliae?in?soil
2020?-?12?-?17?发布 2021?-?01?-?16?实施
天津市市场监督管理委员会 发?布
DB12/T?1006—2020
前 言
本标准按照GB/T?1.1-2009给出的规则起草。
本标准由天津市农业农村委员会提出并归口。
本标准起草单位:天津市植物保护研究所。
本标准主要起草人:高苇、王勇、杨利娟、贲海燕、张春祥、刘晓琳、姚玉荣、王万立。
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茄子黄萎病菌土壤带菌?PCR?检测技术规程
1 范围
本标准规定了茄子黄萎病菌的PCR检测的仪器和试剂、土壤取样、PCR检测、结果判定、土样及资料
保存。
本标准适用于土壤中茄子黄萎病菌的检测。
2 规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡注日期的应用文件,仅注日期的版本适用于本文件。
凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修订版)均适用于本文件。
GB/T?6682 分析实验室用水规格和试验方法
GB/T?36197-2018 土壤质量?土壤采样技术指南
GB/T?36199-2018 土壤质量?土壤采样程序设计指南
3 术语和定义
下列术语和定义适用于本文件。
3.1
茄子黄萎病菌 verticillium?wilt?of?eggplant
茄子黄萎病菌大丽轮枝菌(Verticillium?dahlia?Kleb.)可以侵染多种植物引起一种土传的维管
束病害,病菌可在土壤中长期存活,是茄果类作物生产中危害最为严重的土传病害。茄子黄萎病菌的基
本信息参见附录A。
3.2
微菌核 verticillium?wilt?of?eggplant
茄子黄萎病菌生长过程中,一条或多条菌丝体膨大、细胞壁增厚后,多向芽殖而形成的多细胞结构,
该结构为肉眼可见的黑色菌丝颗粒。
3.3
土壤带菌 soil-borne
土壤中携带能够诱发侵染植株发病的病原菌。
4??仪器和试剂
4.1 主要仪器
涡旋振荡仪、高压灭菌锅、高速冷冻离心机、聚合酶链式反应仪(PCR仪)、水浴锅、电子天平(感
量0.1?g和0.1?mg)、电泳仪、凝胶成像仪。
4.2 主要试剂
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水饱和酚、三氯甲烷、液氮、异丙醇、无水乙醇、DNA荧光染料(Gel?Red)、Tris-HCl等。DNA分
子量标准(DNA?Marker,能够区分100?bp~1000?bp的DNA片段)。
十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)抽提液:2%?CTAB,100?mmol/L?Tris·Cl(pH?8.0),20?mmol/L?EDTA
(pH?8.0),1.4?mol/L氯化钠。
PCR反应混合物:2×Master?Mix:?Taq?DNA聚合酶,2×PCR反应缓冲液,dNTP混合物等。
10×TAE电泳缓冲液:242?gTris-base,57.1?mL冰乙酸,100?mL?0.5?mol/L?EDTA(pH8.0)加蒸馏
水至1000?mL,使用时稀释10倍。
除另有规定外,所有试剂均为分析纯,实验用水符合GB/T?6682要求。
5 待测土壤取样
土壤采样按照GB/T?36199-2018和GB/T?36197-2018的有关要求进行,每块栽培地(面积667m2左右)
按照“S”采样法设置15个采样点,使用不锈钢土壤取样器采集0~40cm耕层土样,将所有采样点土壤混
匀后放入采样袋中。
6 检测与鉴定
6.1 土壤样品预处理
将采集的土壤样品送回实验室后,打开采样袋在室内自然风干(自然风干时间不能超过24?h),然
后采用2?mm孔径的土壤筛过滤土壤,过滤后的土样进行检测。
6.2 样品总?DNA?的提取
每个样品设置3个重复3个平行,每个重复称取1?g土样,放入灭菌的研钵中,加入液氮充分研磨。
向研钵中加入4?mL预热的CTAB抽提液,倒入15?mL灭菌离心管中,反复震荡混合后,65℃水浴30?min,
4℃?14?000?g离心10?min,保留上清液。
取上清液,加入等体积水饱和酚,充分混匀后,4℃?14?000?g离心10?min。
取上清液,加入等体积的三氯甲烷:异戊醇(24:1),4℃?14?000?g离心10?min。继续三氯甲烷:
异戊醇(24:1)抽提,直至有机相和水相之间无蛋白层为止。
吸取上清
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