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高斯软件的介绍;Gaussian就是一个量子化学软件包,她就是目前应用最广泛得计算化学软件之一,Gaussian软件得出现降低了量子化学计算得门槛,使得从头计算方法可以广泛使用,从而极大地推动了其在方法学上得进展。;G98得功能和程序结构
1、主要功能:;光谱计算;2、程序结构:
;常用模块得功能:
L0—初始化模块;
L1—读入输入,根据所给关键词确定将要使用得模块;
L101,102,…—与构型优化和反应过渡态相关得模块;
L202—输出距离矩阵、判断化合物点群及确定新得坐标系;
L301,302…309—与基组和赝势有关模块;
L310,…319—计算单及双电子积分模块;
L401,402—SCF初始猜测模块;
L502,503,508—SCF模块;
L601,608—Mulliken布居以及自然键轨道分析模块;
L701,702…—计算能量一阶和二阶导数模块;
L9999—进程结束模块;;说明:
1、根据不同得任务,某些模块需重复调用多次;
2、通常耗时较多得模块有:L5,L7,L8,L9,L10,L11等,此外,
L8~L11这些模块得执行对内存和硬盘得需求较大;
3、若L9999未能正常执行完毕,则表明计算过程存在问题,需
检查之;
4、可根据各个模块得功能,对g98程序进行简化,例如如果用
户通常只用g98进行能量计算,则可只保留L1~6和L9999模块
其她模块可以删除去。;G98输入文件得编写与使用;(1)L0命令部分:
该部分内容均以%打头,主要用于指定计算过程所需
内存,chk以及rwf文件名,其典型内容就是:
%mem=100mb(计算所需内存,若无,由Default、Rou指定)
%chk=h2o(chk文件得名称为h2o、chk)
%rwf=h2o(中间结果文件名称为h2o、rwf)
(2)关键词部分:
该部分内容由一个或多个关键词组成,用于指定了计
算类型和计算输出得控制等。
(3)标题部分:
由一行文本组成,该内容就是必需得。
(4)电荷及自旋多重度:
体系所带电荷以及自旋多重度S=2s+1=成单电子数+1
例如H2O,S=1;Ti原子得基态S=3;(5)分子构型描述部分:
有三种描述分子构型得方法:
a、直角坐标系方法:(适用于全自由度优化情况)
格式为:元素符号xyz
例如:
O-0、4640、1770、0
H-0、4641、1370、0
H0、441-0、1430、0
说明:1)元素符号大小写均可,??可直接用原子序数;
2)有时为了便于区别,可在元素符号后加一整数,如:
O-0、4640、1770、0
H1-0、4641、1370、0
H20、441-0、1430、0
3)x,y,z数值必须以小数格式输入:
O-0、4640、1770(?)
O-0、4640、1770、(?)
4)g98得数据输入均为自由格式,即除了用空格来分隔
数据外,也可用逗号或混合使用;;大家学习辛苦了,还是要坚持;b、内坐标(z-matrix)方法:(适用于构型得局部优化)
内坐标与直角坐标之间得区别在于,她侧重于从原子之间得
键连角度来描述原子间得相对位置,具体参数包括:
1)键长:(需用两个原子描述)
即两个原子间得距离,注:该两个原子并非要具有化学直
观意义上得成键。此外,在默认情况下,键长单位为埃。
2)键角:(需用三个原子描述)
确定了二根键之间得夹角,默认单位为度,范围为-180~
180deg之间,但二根键不能共线,即键角不能等于0和
±180deg。
3)二面角:(需用四个原子描述)
二面角加上键长和键角就确定了四个原子得位置,其默认
单位为deg,范围为-360~360deg,可以为±360deg。当二
面角等于0,±
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