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本发明公开一种基于哈希学习的相似蛋白质结构检索方法:首先获取蛋白质结构数据集,计算两两之间的相似度信息;针对查询样本,采样正样本与负样本;将蛋白质结构建模为图,并提取节点和边特征,更新节点和边的特征表示,定义量化损失和相似性损失,得到最终损失函数,训练模型。基于训练得到的模型将已收集的每个蛋白质结构表示成二值向量,得到二值向量数据库。在检索时,用训练得到的模型将待检索的新蛋白质结构表示为二值向量,通过直接计算二值向量间的海明距离或是构建倒排索引的方式来检索相似的结构,也可以对基于二值向量检索返回
(19)国家知识产权局
(12)发明专利申请
(10)申请公布号CN117275591A
(43)申请公布日2023.12.22
(21)申请号202311257894.8G06F18/214(2023.01)
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