基于生成树的单体型异质性识别算法设计与实现.docVIP

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2023-12-28 发布于广东
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基于生成树的单体型异质性识别算法设计与实现.doc

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西安交通大学本科毕业设计（论文）

摘要

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基于生成树的单体型异质性识别算法设计与实现

摘要

肿瘤是当今全球主要的死亡原因之一。肿瘤异质性是恶性肿瘤的重要特征，是非常重要的临床指标。准确估计患者肿瘤组织的异质性，有助于推断亚克隆之间、肿瘤-免疫微环境等的进化关系，进而指导肿瘤的精准诊疗。随着高通量基因组测序技术快速发展和普及，基于肿瘤基因组测序数据研究肿瘤异质性逐步成为主流。一批计算模型和算法陆续提出。然而，既有方法的推断和重构结果都是基因型层面的，尚无在单体型层面解析异质性的方法。

为了实现这一目标，在本文中，我们提出了MixSubHap，一种用于定相克