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本发明属于生物技术和药物开发技术领域，具体涉及一种使用BERT特征编码技术和深度学习组合模型来对抗菌肽进行预测的方法。本发明通过从国际上知名的抗菌肽数据库中收集抗菌肽序列作为正样本和从蛋白质数据库收集蛋白质片段残基长度为5至100的序列作为负样本并建立相应的样本集；然后利用BERT预训练模型来对肽序列进行特征编码操作；接着构建由一维卷积神经网络、长短时记忆网络和注意力机制组成的深度学习组合模型和分类模块；再对深度学习组合模型和分类模块构成的整体模型进行训练、评估和利用元学习技术进行参数优化以最大
(19)国家知识产权局
(12)发明专利申请
(10)申请公布号CN117292749A
(43)申请公布日2023.12.26
(21)申请号202311276669.9G06N3/09(2023.01)
(22)申请日2023.10.0
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