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本发明提出了基于德布鲁因图的转录因子结合位点识别方法及系统,包括:从DNA原始片段中提取并筛选出具有高度显著性的k模,并利用德布鲁因图提取并体现k模之间的连接关系;使用汉明距离度量不同k模之间的相似度,通过聚类将高相似度的k模在德布鲁因图中集聚以获得构成模体的基本簇;最终模体的确认由一个基于基本簇的路径扩展过程给出,该过程中,构成相同模体的基本簇将被连接起来,形成最终输出的概率权重矩阵。
(19)国家知识产权局
(12)发明专利申请
(10)申请公布号CN117393041A
(43)申请公布日2024.01.12
(21)申请号202311613775.1
(22)申请日2023.11.29
(71)申请人山东大学
地址250100
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