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动物细菌常见主要耐药基因检测技术
1范围
本文件规定了动物细菌常见主要耐药基因的PCR检测技术要求。
本文件适用于在生物安全Ⅱ级(BSL-2)以上的实验室进行动物细菌四环素类、喹诺酮类、氨基糖
苷类、磺胺类及氯霉素类主要常见耐药基因的检测及gyrA、gyrB、parC和parE基因的突变分析。
2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文
件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
中华人民共和国农业部农医发〔2017〕25号病死及病害动物无害化处理技术规范
GB19489-2008实验室生物安全通用要求
GB/T19495.2-2004转基因产品检测实验室技术要求
SN/T2025-2016动物检疫实验室生物安全操作规范
SN/T3640-2013出口食品中致泻大肠杆菌检测方法PCR法
SN/T2206.12-2014化妆品微生物检验方法第12部分:绿脓杆菌PCR法。
兽医实验室生物安全技术管理规范
中华人民共和国农业部公告第302号(《兽医实验室生物安全技术管理规范》)
3术语和定义
本文没有需要界定的术语或定义。
4缩略语
下列缩略语适用于本文件。
bp:碱基对(basepair)
DNA:脱氧核糖核酸(deoxyribonucleicacid)
DNase:脱氧核糖核酸酶(deoxyribonuclease)
dNTP:脱氧核糖核苷三磷酸(deoxy-ribonucleosidetriphosphate)
PCR:聚合酶链式反应(polymerasechainreaction)
Taq酶:TaqDNA聚合酶(TaqDNApolymerase)
TE缓冲液:TE缓冲液(Tris-EDTAbuffersolution)
TAE:三羟甲基氨基甲烷-乙酸电泳缓冲液(Trisaate-EDTAbuffer)
5原理
3
根据动物细菌tet(A)、tet(B)、tet(C)、tet(M)、gyrA、gyrB、parC、parE、aac(6’)-Ib-cr、
aac(3)-IV、aacC4、sul1、sul2、dfrA1、cmlA和cat1等常见的主要耐药基因序列设计特异性引物,在
DNA聚合酶催化下,以母链DNA为模板,以引物为延伸起点,通过变性、退火和延伸,体外复制出与
母链模板DNA互补的子链DNA。
6仪器和器材
6.1高速台式冷冻离心机(离心范围0~20000r/min)
6.2冰箱:4℃±1℃冰箱,-20℃±1℃冰箱,-70℃±1℃冰箱。
6.3PCR扩增仪
6.4电泳仪
6.5凝胶成像系统
6.6微波炉
6.7分析天平
6.8离心管:15mL离心管、1.5mL离心管和0.2mLPCR专用离心管。
6.9微量可调移液器:1000μL,200μL,100μL,50μL,20μL,10μL,2μL。
7试剂和引物
注:本技术规范中使用的试剂,除另有说明外,所有实验使用的试剂等级均为不含DNA或DNase
的分析纯或生化试剂;所有试剂均用无菌的容器分装。
7.1DNA抽提试剂:DNAzol®Reagent,外观为淡绿色,于4~8℃保存。
7.2无水乙醇:-20℃预冷。
7.375%乙醇:用无水乙醇和灭菌双蒸水配制,-20℃预冷。
7.4Taq酶:ExTaqDNA聚合酶(5U/μL)。
7.5dNTP(2.5mmol/L)。
7.6阴性对照:灭菌双蒸水。
7.7阳性对照:动物细菌耐药菌株。
7.8无菌生理盐水。
7.9TE缓冲液(pH
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