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动物细菌常见主要耐药基因检测技术.pdfVIP

动物细菌常见主要耐药基因检测技术.pdf

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动物细菌常见主要耐药基因检测技术

1范围

本文件规定了动物细菌常见主要耐药基因的PCR检测技术要求。

本文件适用于在生物安全Ⅱ级(BSL-2)以上的实验室进行动物细菌四环素类、喹诺酮类、氨基糖

苷类、磺胺类及氯霉素类主要常见耐药基因的检测及gyrA、gyrB、parC和parE基因的突变分析。

2规范性引用文件

下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文

件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。

中华人民共和国农业部农医发〔2017〕25号病死及病害动物无害化处理技术规范

GB19489-2008实验室生物安全通用要求

GB/T19495.2-2004转基因产品检测实验室技术要求

SN/T2025-2016动物检疫实验室生物安全操作规范

SN/T3640-2013出口食品中致泻大肠杆菌检测方法PCR法

SN/T2206.12-2014化妆品微生物检验方法第12部分:绿脓杆菌PCR法。

兽医实验室生物安全技术管理规范

中华人民共和国农业部公告第302号(《兽医实验室生物安全技术管理规范》)

3术语和定义

本文没有需要界定的术语或定义。

4缩略语

下列缩略语适用于本文件。

bp:碱基对(basepair)

DNA:脱氧核糖核酸(deoxyribonucleicacid)

DNase:脱氧核糖核酸酶(deoxyribonuclease)

dNTP:脱氧核糖核苷三磷酸(deoxy-ribonucleosidetriphosphate)

PCR:聚合酶链式反应(polymerasechainreaction)

Taq酶:TaqDNA聚合酶(TaqDNApolymerase)

TE缓冲液:TE缓冲液(Tris-EDTAbuffersolution)

TAE:三羟甲基氨基甲烷-乙酸电泳缓冲液(Trisaate-EDTAbuffer)

5原理

3

根据动物细菌tet(A)、tet(B)、tet(C)、tet(M)、gyrA、gyrB、parC、parE、aac(6’)-Ib-cr、

aac(3)-IV、aacC4、sul1、sul2、dfrA1、cmlA和cat1等常见的主要耐药基因序列设计特异性引物,在

DNA聚合酶催化下,以母链DNA为模板,以引物为延伸起点,通过变性、退火和延伸,体外复制出与

母链模板DNA互补的子链DNA。

6仪器和器材

6.1高速台式冷冻离心机(离心范围0~20000r/min)

6.2冰箱:4℃±1℃冰箱,-20℃±1℃冰箱,-70℃±1℃冰箱。

6.3PCR扩增仪

6.4电泳仪

6.5凝胶成像系统

6.6微波炉

6.7分析天平

6.8离心管:15mL离心管、1.5mL离心管和0.2mLPCR专用离心管。

6.9微量可调移液器:1000μL,200μL,100μL,50μL,20μL,10μL,2μL。

7试剂和引物

注:本技术规范中使用的试剂,除另有说明外,所有实验使用的试剂等级均为不含DNA或DNase

的分析纯或生化试剂;所有试剂均用无菌的容器分装。

7.1DNA抽提试剂:DNAzol®Reagent,外观为淡绿色,于4~8℃保存。

7.2无水乙醇:-20℃预冷。

7.375%乙醇:用无水乙醇和灭菌双蒸水配制,-20℃预冷。

7.4Taq酶:ExTaqDNA聚合酶(5U/μL)。

7.5dNTP(2.5mmol/L)。

7.6阴性对照:灭菌双蒸水。

7.7阳性对照:动物细菌耐药菌株。

7.8无菌生理盐水。

7.9TE缓冲液(pH

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