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基于SSSL的水稻稻瘟病QTL的定位与聚合的中期报告
一、研究背景
水稻是我国主要的粮食作物，但同时也受到病虫害的威胁。稻瘟病是水稻的一种重要病害，严重影响了水稻产量和质量。因此，对稻瘟病的抗性进行研究是非常必要的，特别是从分子水平上进行研究，以期望找到抗性相关的遗传基础，从而为水稻的遗传改良提供依据。本研究基于SSSL（simplesequencelengthpolymorphism）技术对水稻稻瘟病相关QTL（quantitativetraitlocus）进行定位与聚合。
二、研究目的
本研究旨在利用SSSL技术对水稻抗稻瘟病QTL进行定位与聚合，以期望得到受体抗性、基因表达和关键代谢途径等方面的线索。
三、研究方法
1.材料选用
本次研究选用了中国水稻宽适应205种（OryzasativaL.）的后代SSSL遗传材料。
2.子群体划分
按照颖花期、居高度和单株产量等特征，将以上材料分为若干子群体并分别进行SSSL遗传分析。
3.遗传图谱的构建
以已知的SSSL位点为定位基准，采用PCR扩增方法扩增目标片段，利用聚丙烯酰胺凝胶电泳分析与鉴定。根据分析结果，构建遗传图谱并计算各QTL的连锁初始值。
4.QTL的定位与聚合
采用四种定位方法：经典QTL分析法、联合QTL分析法、复杂分析法和HMAP1法，对QTL进行定位与聚合。
5.生物信息学分析
利用NCBI数据库获得已知QTL信息、基因序列信息、生物途径信息等，并作进一步生物信息学分析。
四、研究进展
1.选材
已完成中国水稻宽适应205种后代SSSL遗传材料的筛选和选择。
2.子群体划分
已完成材料的准确子群体划分。
3.遗传图谱的构建
目前，已经得到若干个QTL的定位和连锁建图，并计算了各QTL的连锁初始值。
4.QTL的定位与聚合
正在进行QTL的定位与聚合工作，旨在找出最可信的QTL个体，并有望揭示重要抗性位点的分子机制。
5.生物信息学分析
正在进行生物信息学分析，并作为QTL分析的补充工作进行。
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