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- 2024-02-21 发布于上海
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白颊长臂猿Fosmid基因组文库的构建的中期报告
白颊长臂猿是一种珍稀的猿类动物,目前受到严重威胁。为了更好地了解其基因组信息,我们进行了白颊长臂猿的Fosmid基因组文库的构建工作,并已经完成了其中间的阶段。
在本次工作中,我们使用BionanoGenomics技术进行了高质量的基因组DNA分子的一个阵列分析。该技术不需要对DNA进行任何的预处理,具有高精度的优点。我们还使用了PacBioRSII测序平台进行了长读取取样,并使用Illumina测序平台进行了短读取取样。最终,我们将得到的这些数据组合起来,进行了一些比对和评估的工作。
截至目前,我们已经完成了白颊长臂猿基因组的Fosmid文库的构建工作,这一阶段主要工作包括:
1.DNA样本的采集和提取
我们在中国南方的广西和越南北部采集了两种不同种群的白颊长臂猿组织样本,包括肌肉、血液和口腔粘膜。通过简单的提取方法和纯化步骤,我们得到了高质量的DNA样本。
2.Fosmid文库的构建
我们使用的是pCC1FOS?-HC(highcopy)载体,使用奇数荧光制造Fosmid克隆库,对于奇数荧光谱的细胞用128通道扫描仪包装进板子中。此外,我们还进行了大量操作,例如限制性内切酶消化、纯化、连接、转化和选材。这些步骤都是为了保证文库的稳定和高密度的克隆。
3.文库的筛选和评估
为了筛选出质量优良的Fosmid克隆,我们接
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